战争双方，轮番对江西进行破坏。清军方面，江忠源为了抵抗太平军，曾在南昌城外实施焦土作战策略，把城外民居烧个精光，连滕王阁都未能幸免。根据历史学家曹树基的测算，1851年，太平天国战争刚爆发，尚未波及江西，江西人口达到2400多万；1865年，太平天国战争结束，江西人口锐减为1200多万。十余年间，江西人口损失了一半。
在这场战争中，江西不幸从商家必争之地，变成了兵家必争之地。整个太平天国战争时期，江西商人成为湘军的提款机。湘军在江西的军费募款（实际上是摊派），高达1.3亿两，排在全国前列。
不仅如此，没有特权庇护的江西商人此后屡屡被当成肥猪“宰掉”。国内哪个省有战事，他们首先想到的，就是到江西弄点钱，最高峰时甚至出现了几省同时在江西设局劝捐的局面。时任江西巡抚刘坤一实在看不过眼，多次向朝廷上书，说江西历经太平天国战争，已经全省糜烂，民力难支，浙江、安徽刚来刮过一轮了，陕甘云贵四省又来，“凡属殷实之家，早已精疲力竭，目下可捐之户，殊觉无多”。再这样捐下去，地主家也没有余粮了。大约在清末，遭受重重打击的江西商帮，从此寂寂无闻。
